Een Faunabeheereenheid (FBE) is volgens de Flora- en faunawet een samenwerkingsverband van jachthouders, waarbij met jachthouder diegene bedoeld wordt die gerechtigd is tot het gehele of gedeeltelijke genot van de jacht. Een faunabeheereenheid wordt erkend ten behoeve van:
a. het beheer van diersoorten en
b. de bestrijding van schade aangericht door dieren.
Op 5 juli 2005 zijn in Limburg drie Faunabeheereenheden door Gedeputeerde Staten (GS) erkend, te weten de Stichting Faunabeheereenheid Noord-, Midden- en Zuid Limburg. GS hebben tegelijk de faunabeheerplannen van deze stichtingen goedgekeurd. In deze beheerplannen is per diersoort aangegeven waar ze voorkomen, wat het duurzaam beheer in moet gaan houden en wat de aard, omvang en noodzaak van de te verrichten handelingen zijn. Ook staat erin op welke wijze en in welke periode de handelingen worden verricht.
Op 1 januari 2008 zijn de 3 bovengenoemde Faunabeheereenheden gefuseerd tot één Faunabeheereenheid Limburg.